Dr.エッグマンとの戦いの中、ソニックたちは古代の寺院へと迷い込んでしまった！そこには遥か昔に封印された破壊の使者「リリック」が眠っていた……。ソニックのちょっとしたミスで封印から解き放たれたリリックは、古代兵器を使い、世界のすべてを滅ぼそうと動き出してしまう！
古代から伝わる秘宝「クリスタル」を集めて、リリックを再び封印するため、ソニックは仲間と共に冒険の旅に出る。はたしてソニックたちは世界を救えるのだろうか！？
Dr.エッグマンとの戦いの中、ソニックたちは古代の寺院へと迷い込んでしまった！そこには遥か昔に封印された破壊の使者「リリック」が眠っていた……。ソニックのちょっとしたミスで封印から解き放たれたリリックは、古代兵器を使い、世界のすべてを滅ぼそうと動き出してしまう！
古代から伝わる秘宝「クリスタル」を集めて、リリックを再び封印するため、ソニックは仲間と共に冒険の旅に出る。はたしてソニックたちは世界を救えるのだろうか！？
Wii U版のアクションは謎解き要素が盛りだくさんで、探索やバトルに特化している。それぞれのキャラクターが得意とする能力を武器に、協力しながらエネミーと戦い、謎を解いて冒険を進めよう！
テイルスが古代テクノロジーを利用して発明したブレスレットから放たれる“エナービーム”はあらゆるものに吸着し、物を引っ張ったり、ビームの伸び縮みを利用して、大ジャンプすることができる！エナービームを上手に使い分けて冒険を進めよう！
自慢の足を使って、素早いキックコンボでエネミーと戦う！目にも止まらぬ高速の連続コンボ等、ソニックらしいスピード感のある様々なアクションでエネミーを蹴散らす！
メカに強い持ち前の才能を発揮！バクダンやミサイルの他、新しく発明した小型二足歩行爆弾“バディーボット”を使って小さな隙間にある隠れたスイッチを爆破するなど、自慢のメカを使ってエネミーと戦う！
丸太の様に太い腕から強烈なパンチコンボを繰り出す！ 固いエネミーはナックルズにお任せ！ 地面を掘り進めて隠されたルートを移動することもできる！
身軽なエミーは三段ジャンプをすることができ、複雑な足場も華麗に飛び乗る。愛用のハンマーで迫りくるエネミーをなぎ倒すパワフルさも持っている。
NEW
勢いよく踏みつける事で、地面に強力な古代エネルギーを注入し、そのポイントを中心に巨大な大爆発を発生させるスイッチ。爆発範囲も広く、凄まじい破壊力を持った最強のサポートウェポン。
サイズは小さいが、強力な風力を持つサイクロンを発生させる銃。古代エネルギーを風力としており、発射されたサイクロンは風力を落とす事無く、触れたモノを勢いよく吹き飛ばす。非常に強力なサポートウェポン。
発射すると銃身からマジックハンドが飛び出し、目の前にある様々なモノに往復ビンタで攻撃を仕掛ける不思議な武器。マジックハンドが短い為、射程距離は短いが強い破壊力を持つコミカルなウェポン。
一見、ただの巨大な水風船の様だが、古代文明のメカである破壊兵たちは、水をかけられればたちまちショートしてしまうため、破壊兵たちは何よりも恐れている。とても原始的かつ合理的なサポートウェポン。
トランペット内で生成されたエネルギーを弾性波へと変換し、一気に周囲へ浸透させる強力な音波楽器。楽器として作成されたわけではないので、誰が吹いても必ず強力な攻撃ができるサポートウェポン。
太古に生息していたと言われている伝説の鳥類の羽をベースに作成された剣。一振りすることで刀身より風切羽が撃ちだされ、広範囲に飛散される。威力は弱めだが、遠距離からも攻撃出来るサポートウェポン。
どんな水流にも負けず、世界の海を渡るのに役立つ古代の技術を結集した戦闘艇。現在は持ち主の趣向により、ただのボートとして扱われている。このボートは４人乗りで、各乗り場にそれぞれの役割分担がされている。１名は操縦を担当し、他３名は搭載されているウェポンを担当する。乗組員全員が力を合わせる事で初めて実力が発揮される強力なサポートビークル。
古代族が古代テクノロジーの粋を結集させ、作り上げた潜水艦。非常にコンパクトなため、二人しか搭乗出来ないが、その分高速航行に特化した作りとなっており、当時作られていた一般的な潜水艦の５倍のスペックを誇る。また、水中での激しい戦闘にも対応できるよう、様々な改造が施されており、どんな強固な岩盤も一撃で粉砕するツイントルペード砲をメイン武器として装備する。
NEW!『ソニックトゥーン 太古の秘宝』では、本編のストーリーモード中もTVモニターとWii U GamePadを使って最大２人で同時に遊べる協力プレイが可能。また、２人以上でも楽しめる「チームチャレンジ」と呼ばれるマルチプレイモードを用意。「チームチャレンジ」は最大４人で楽しむ事ができ、ルールやステージを選んでスコアを競う「対戦」プレイや、協力してゴールを目指す「協力」プレイを楽しむ事ができます。
本編にも登場する村の中央広場や、アクションエリアに用意された円形闘技場を舞台に次々と押し寄せる破壊兵団を相手に仲間同士で協力し、生き残りをかけて挑むバトルゲームです。如何に仲間と助け合い、協力できるかが、クリアのカギとなっています。
古代文明に存在した研究施設を舞台に用意されたトラップだらけの障害物レース。 迫りくる破壊兵団はもちろん、コース上に用意された様々なトラップや障害物を回避しながら、時には仲間と協力し、時には仲間を出し抜きつつゴールを目指すルールです。
「コレクト・ボール」と呼ばれるクリスタルのカケラを吸着させる事が出来るボールをエナービームで操り、ステージ上に出現するクリスタルのカケラをより多く集め、ゴールであるワームホールへ投げ入れる古代族の競技ルールです。
NEW!Wii U版/3DS版の二機種で発売される『ソニックトゥーン』は「連動要素」を搭載。3DS版のセーブデータをWii U版に送ると、ソニックの持てる最大リング所持数がアップするスペシャルスキルをゲット出来ます。さらに、3DS版のゲーム進行具合とWii U版のスキルレベルは連動しており、3DS版のゲームを進めれば進める程、よりレベルの高いスペシャルスキルをゲットする事ができます！
